بدأت رحلة المخبر الوطني لتأسيس نظامٍ لإدارة الجودة لديه في التسعينيات من القرن الماضي، حيث كانت هنالك محاولات لبناء هذا النظام وفق متطلبات الدليل الإرشادي ISO/IEC Guide 25:1990 (متطلبات عامة لكفاءة مخابر المعايرة والاختبار).
عندما صدرت المواصفة القياسية الدولية ISO/IEC 17025:1999 (متطلبات عامة لكفاءة مخابر الاختبار والمعايرة)، بدأ المخبر الوطني بتطوير نظام إدارة الجودة لديه بما ينسجم مع متطلباتها، فتم تعديل الإجراءات المستخدمة وإعداد الإجراءات الجديدة المطلوبة، مع التركيز على ثلاث مجموعات من المجموعات الثمانية التي يتألف منها المخبر، وهي مجموعات التيار المستمر والكتل والضغط تمهيداً لاعتمادها من قبل جهة اعتماد معترف بها دولياً.
بدأ في النصف الثاني من عام 2005 تنفيذ المشروع السوري الألماني "تعزيز البنية التحتية للجودة في سوريا"، ممثلاً بالمعهد الوطني للمترولوجيا في ألمانيا (PTB) عن الجانب الألماني، وبهيئة تخطيط الدولة في الجمهورية العربية السورية (SPC) عن الجانب السوري، وجرى اختيار عدد من مخابر الاختبار والمعايرة السورية، ومن ضمنها المخبر الوطني، من خلال أحد المكونات الرئيسة للمشروع وهو "تعزيز قدرات مؤسسات البنية التحتية السورية للجودة "، وذلك بهدف تقديم الدعم الفني اللازم لها لتأسيس/مواءمة أنظمة إدارة للجودة لديها بما يتوافق مع متطلبات المواصفة القياسية الدولية ISO/IEC 17025:2005.
تقدّم المخبر الوطني بطلب اعتماد إلى خدمات المعايرة الألمانية (DKD) بتاريخ 19/ 2 /2007 مرفقاً بالملاحق والوثائق المطلوبة وجرى قبول الطلب وإعطائه رقماً: DKD-K-48601. ومن ثم تمت تسمية فريق لتقييم نظام إدارة الجودة والأنشطة الفنية في المخبر برئاسة المدقق الرئيس الدكتور A. Odin وعضوية المقيّمين الفنيين السادة الدكتور M. Klonz والدكتور M. Kochsiek والسيد W. Schultz.
بناء على طلب رئيس فريق التقييم Dr. Odin، قام المخبر الوطني بتزويد الفريق بعينات من وثائق نظام إدارة الجودة بهدف تقييم مدى مطابقة التوثيق لمتطلبات المواصفة ISO/IEC 17025:2005 (التدقيق المكتبي). وبعد انتهاء التدقيق المكتبي بنجاح، وضع فريق التقييم برنامج عمليات التقييم في الموقع التي تهدف إلى تحديد مدى مطابقة الممارسات العملية في المخبر للنظام الموثق، وكذلك تقييم مدى فاعلية تطبيق النظام والأنشطة الفنية في المخبر.
تم تنفيذ التقييم في الموقع من خلال ثلاث زيارات:

• تقييم الأنشطة الفنية لمجموعة التيار المستمر من قبل المقيم الفني Dr. Klonz خلال الفترة 18- 26/11/2007.
• تقييم الأنشطة الفنية لمجموعة الكتل من قبل المقيم الفني Dr. Kochsiekخلال الفترة 17-18/12/2007، وعلى التوازي، تقييم نظام إدارة الجودة في المخبر من قبل السيد رئيس فريق التقييم Dr. Odin.
• تقييم الأنشطة الفنية لمجموعة الضغط من قبل المقيم الفني Mr. Schultz خلال الفترة 20-24/1/2008.

تم تقييم كفاءة المجموعات الثلاثة باستخدام معايير مرجعية حملها المقيمون معهم، بينما تضمنت عملية تقييم نظام إدارة الجودة محاكاة للعمليات المتعلقة بالزبون بدءاً من استلام طلبات الزبائن وتجهيزاتهم ومعالجتها وانتهاءً باسترجاع التجهيزات واستلام شهادات المعايرة من قبلهم.
بتاريخ 7/2/2008، اتخذ فريق التقييم قراراً باعتماد المخبر الوطني للمجال الموثق في طلب الاعتماد (الضغط والكتلة والموازين والكميات الكهربائية المتصلة بالتيار المستمر والتردّد المنخفض)، وصدرت شهادة الاعتماد بتاريخ 4/4/2008، ليكون المخبر الوطني بذلك أول مخبر في الجمهورية العربية السورية يتم اعتماده من جهة اعتماد معترف بها دولياً. وقد تم في حينه نشر مجال الاعتماد على موقعي المخبر الوطني والـ DKD.
بعد اعتماد نظام إدارة الجودة في المخبر، اجتاز هذا النظام بنجاح زيارتي مراقبة (Surveillance visits) نُفّذت الأولى خلال شهر أيار 2009 من قبل فريق يعمل لصالح الـ DKD، بينما نُفّذت الثانية خلال شهر تشرين الأول 2010 من قبل فريق آخر يعمل لصالح مجلس الاعتماد الألماني الجديد (DAkkS).وقد كان مقرَّراً أن تكون هنالك زيارة ثالثة خلال شهر نيسان 2012، وهي الأخيرة في دورة الاعتماد التي تبلغ مدتها خمس سنوات ويتم في نهايتها إعادة تقييم المخبر بشكل كامل من جديد (Re-assessment). إلا أن تعذّر قدوم المقيمين لتنفيذ التقييم بسبب الظروف الراهنة للبلد أدى إلى تعليق اعتماد المخبر من قبل الـ DAkkS اعتباراً من الرابع من شهر أيار 2012.
من ناحية أخرى، بدأ خلال النصف الثاني من العام 2008 تنفيذ مشروع " تعزيز الإدارة والإمكانات والبنية التحتية للجودة في سوريا"، ضمن إطار العلاقات القائمة بين الجمهورية العربية السورية، ممثلة بوزارة الصناعة، والاتحاد الأوروبي، ممثلاً بالبعثة الأوروبية (European delegation) في دمشق. وقد قدّم المشروع الدعم الفني اللازم للمخبر الوطني لتوسيع مجال نظام إدارة الجودة المعتمد لديه ليشمل الأنشطة الفنية لمجموعات التيار المتناوب والأبعاد الهندسية والحرارة والرطوبة، وكان مقرراً له أن يستمر حتى منتصف العام 2012، إلا أنه جرى توقيف العمل فيه في النصف الثاني من العام 2011 ولم تكتمل ضمن إطاره عملية توسيع النظام، كما لم يتم تقييمه من قبل جهة ثالثة.
إن إدارة المخبر الوطني ملتزمة بالمحافظة على نظام إدارة الجودة المطبّق وتحسينه باستمرار، وتقوم بتخصيص الموارد الضرورية لهذه الغاية. وقد جرى خلال الفترة الماضية إتمام الأنشطة التي تم البدء بتنفيذها ضمن إطار مشروع الاتحاد الأوروبي بخصوص توسيع مجال النظام، وهو جاهز الآن للتقييم من قبل جهة ثالثة.